Ехінацея може спричинити алергічні реакції у схильних до цього пацієнтів. Частота їх виникнення невідома. Рідко можуть спостерігатися реакції гіперчутливості у вигляді почервоніння шкіри, свербежу, набряку обличчя. Іноді можливі висипання, кропив’янка, синдром Стівенса-Джонсона, ангіоневротичний набряк шкіри, набряк Квінке, утруднення дихання, бронхоспазм з обструкцією, бронхіальна астма, анафілактичний шок. Нечасто можливі запаморочення, артеріальна гіпотензія, нудота, блювання, діарея.
Були окремі повідомлення про аутоімунні захворювання, пов’язані із застосуванням цього лікарського засобу.
При тривалому застосуванні (понад 8 тижнів) може виникнути лейкопенія.